Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms