Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNT1Q5JUK3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms