Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms