Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC23Q53EV4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms