Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPAT3Q53EU6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms