Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms