Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SP6Q3SY56 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SP6Q3SY56 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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