Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms