Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms