Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC57Q2TAC2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC57Q2TAC2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC57Q2TAC2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC57Q2TAC2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC57Q2TAC2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC57Q2TAC2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms