Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms