Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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