Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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LAMA3Q16787 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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LAMA3Q16787 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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LAMA3Q16787 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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LAMA3Q16787 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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LAMA3Q16787 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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LAMA3Q16787 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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LAMA3Q16787 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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