Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NTRK2Q16620 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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NTRK2Q16620 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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