Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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