Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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