Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms