Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms