Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLINT1Q14677 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLINT1Q14677 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms