Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms