Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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