Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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SHROOM2Q13796 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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SHROOM2Q13796 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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