Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms