Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1SQ13698 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1SQ13698 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1SQ13698 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1SQ13698 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1SQ13698 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1SQ13698 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1SQ13698 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1SQ13698 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms