Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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