Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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