Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LSAMPQ13449 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LSAMPQ13449 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LSAMPQ13449 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LSAMPQ13449 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LSAMPQ13449 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LSAMPQ13449 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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