Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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MKRN4PQ13434 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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MKRN4PQ13434 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC013452.2-201ENST00000557910 743 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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MKRN4PQ13434 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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MKRN4PQ13434 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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MKRN4PQ13434 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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MKRN4PQ13434 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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MKRN4PQ13434 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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