Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms