Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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