Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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