Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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