Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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CDH17Q12864 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CDH17Q12864 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CDH17Q12864 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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