Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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