Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms