Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms