Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms