Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXM1Q08050 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms