Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms