Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR1Q03591 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR1Q03591 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR1Q03591 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms