Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms