Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms