Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms