Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms