Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms