Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMF1P82094 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMF1P82094 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMF1P82094 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMF1P82094 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMF1P82094 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMF1P82094 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMF1P82094 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMF1P82094 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms