Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms