Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms