Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms