Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms